Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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CntfrO88507 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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CntfrO88507 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms