Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms