Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpk1O70551 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms