Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AurkbO70126 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms