Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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