Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg2O55111 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms