Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Copb2O55029 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Copb2O55029 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Copb2O55029 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Copb2O55029 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Copb2O55029 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Copb2O55029 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms