Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk2a2O54833 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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