Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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