Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NmbrO54799 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NmbrO54799 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NmbrO54799 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NmbrO54799 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NmbrO54799 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbrO54799 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NmbrO54799 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NmbrO54799 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NmbrO54799 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NmbrO54799 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NmbrO54799 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NmbrO54799 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NmbrO54799 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbrO54799 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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NmbrO54799 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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