Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Srpk2O54781 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srpk2O54781 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms