Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EdaO54693 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EdaO54693 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EdaO54693 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EdaO54693 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EdaO54693 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EdaO54693 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EdaO54693 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EdaO54693 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EdaO54693 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EdaO54693 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms