Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FxnO35943 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FxnO35943 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FxnO35943 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FxnO35943 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FxnO35943 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FxnO35943 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FxnO35943 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FxnO35943 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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