Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sp100O35892 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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