Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CaluO35887 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CaluO35887 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CaluO35887 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CaluO35887 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CaluO35887 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CaluO35887 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CaluO35887 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms