Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cops5O35864 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cops5O35864 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cops5O35864 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops5O35864 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms