Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfibp2O35711 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfibp2O35711 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms