Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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