Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xbp1O35426 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms