Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Efnb3O35393 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms