Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcc1O35379 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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