Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ColqO35348 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ColqO35348 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ColqO35348 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ColqO35348 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ColqO35348 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ColqO35348 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ColqO35348 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ColqO35348 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ColqO35348 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ColqO35348 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ColqO35348 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ColqO35348 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ColqO35348 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ColqO35348 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ColqO35348 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ColqO35348 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ColqO35348 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ColqO35348 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ColqO35348 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ColqO35348 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ColqO35348 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms