Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcns1O35173 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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