Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms