Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq2O09161 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq2O09161 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq2O09161 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq2O09161 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Casq2O09161 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq2O09161 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms