Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps1O08983 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps1O08983 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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