Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eftud2O08810 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eftud2O08810 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eftud2O08810 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eftud2O08810 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eftud2O08810 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Eftud2O08810 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eftud2O08810 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eftud2O08810 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms