Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17078M0QW51 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms