Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8050L7N2E3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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