Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 3930402G23Rik-201ENSMUST00000040608 3086 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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