Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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