Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm933J3QPC1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms