Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms