Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20795J3QP49 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms