Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim22J3QP37 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim22J3QP37 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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