Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms