Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm17577J3QNF7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms