Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc180J3QNE4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc180J3QNE4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms