Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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