Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E030018B13RikJ3QMS9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms