Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms