Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf148G3X9R7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms