Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Arfgef1G3X9K3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arfgef1G3X9K3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms