Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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