Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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