Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28038F7BCN9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.6 ms