Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atf6F6VAN0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atf6F6VAN0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atf6F6VAN0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atf6F6VAN0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atf6F6VAN0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6F6VAN0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms