Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm28374F6SG70 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28374F6SG70 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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