Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngap1F6SEU4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms