Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgef5E9Q7D5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms